O Observatório Institucional da Reitoria da Unifesp integra a rede de observatórios criados para promover a articulação democrática, participativa e dialógica, com o objetivo de aprimorar a atuação dos institutos e fortalecer sua relação com a comunidade. Assim como os demais observatórios, ele visa realizar análises, reflexões, coleta de dados e geração de conhecimentos, além de fornecer subsídios e recomendações para dar visibilidade a questões sociais, políticas públicas e processos de relevância socioambiental e de garantia de direitos.
Como parte do Câmpus Reitoria, o NEI-Paulistinha participa do Observatório, alinhando suas ações com outros órgãos do câmpus e contribuindo para uma rede integrada de pesquisa e extensão.